补办契税发票需要支付相应的税款，具体金额计算方式为房产契税金额乘以税率（通常为千分之五）再加上印花税。以契税金额100万元为例，补办契税发票需要支付5000元税款。另外，还需要支付印花税，具体金额为契税金额的百分之一。因此，综合计算补办契税发票的总费用为10000元。需前往当地税务局办理补办手续，并在缴费后领取正式的契税发票。
