南京审计学院在经济学方面更好。该学院拥有较为完善的经济学专业设置和师资力量,其经济学相关课程和研究具有一定的影响力和水平。同时,南京审计学院还与多家企业和机构建立了紧密的合作关系,为学生提供实习和就业机会。相比之下,苏州大学在经济学方面的实力相对较弱,相对南京审计学院来说在这个领域上的优势不明显。因此,如果重视经济学专业的教学质量和学术研究水平,南京审计学院是一个更好的选择。