根据目前的研究和临床实践，青霉素更常用于治疗锦鲤烂尾病。青霉素是一种广谱抗生素，对包括细菌在内的许多病原体都有很好的疗效。而土霉素虽然也是一种抗生素，但在治疗锦鲤烂尾病时疗效并不如青霉素明显。因此，一般情况下，青霉素被认为是更好的选择来治疗锦鲤烂尾病。当然，在具体使用时，应根据兽医的指导来选择合适的药物和治疗方案。
