基础医学的优点是为临床医学提供理论基础和支撑,培养学生扎实的医学知识和科研能力;预防医学的优点是能预防疾病的发生,减少医疗资源浪费,提高人群健康水平。基础医学的缺点是与实际治疗应用有一定距离,应用于临床需要结合其他学科知识;预防医学的缺点是工作范围广泛,难以深入研究某一领域,且效果不直观。但是两者的结合能够有效提高医疗质量和效率。