如果您的利润总额亏损了六十多万，税务部门通常不会主动查账。因为亏损意味着您没有利润需要纳税。然而，如果您发现亏损是由于不当操作或涉及税务失误，建议及时向税务部门报告情况，以免后续可能出现的问题。总的来说，亏损并不会自动引起税务部门的审核，但合规和诚实是维护企业信誉和合法经营的重要原则。
